Mavzu: Ureaza fermenti Reja: Tarixi

Faol sayt

Faol sayt

Ureazalarning faol joyi a (alfa) bo'linmalarida joylashgan. Bu bis-m-gidrokso dimerik nikel markazi, atomlararo masofasi ~ 3,5 Å. Ni (II) juftligi zaif antiferromagnit bog'langan. Canavalia ensiformis (jack bean), Klebsiella aerogenes va Sporosarcina pasteurii (ilgari Bacillus pasteurii nomi bilan tanilgan) rentgen-absorbtsiya spektroskopiyasi (XAS) bo'yicha o'tkazilgan tadqiqotlar, faqat imidazol ligandlarini o'z ichiga olgan, faqat O/N ligasi bo'lgan 5-6 koordinatali nikel ionlarini tasdiqlaydi. nikel uchun. Karbamid substrat akvigandlarni almashtirish uchun tavsiya etiladi. Faol joy ochilishi tomon joylashgan suv molekulalari tetraedral klaster hosil qilib, bo'shliqni vodorod aloqalari orqali to'ldiradi. Ba'zi aminokislotalar qoldiqlari saytning harakatlanuvchi qopqog'ini hosil qilish uchun taklif qilinadi, bu substrat uchun eshikdir. Sistein qoldiqlari fermentlar flapida tez -tez uchraydi, ular katalizda muhim emasligi aniqlangan, garchi faol maydonda boshqa asosiy qoldiqlarni to'g'ri joylashtirishda ishtirok etsa. Sporosarcina pasteurii ureazada qopqoq ochiq konformatsiyada topilgan, reaksiya uchun uning yopiq konformatsiyasi kerak bo'ladi. Taqqoslaganda, Helicobacter pylori urease va boshqa bakterial üreazalarning a -bo'linmalari jek loviya ureazalariga to'g'ri keladi. Karbamidning üreazaning faol joyiga bog'lanishi kuzatilmagan.