Мавзу: пептид ва оксиллар

2. ОКСИЛЛАРНИНГ 2 ЛАМЧИ ТУЗИЛИШИ
Оксилларнинг 2 ламчи тузилиши асосан Н-боглари хисобига шаклланиб, полипептид занжирининг фазодаги маълум бир тартибда жойлашувини белгилайди. 2 ламчи тузилишининг асосий турлари -спирал, -структураси ва коллаген спирал булиб хисобланади. Пептидлар ва оксилларнинг тузилиши ва ундаги электрон булутининг таксимланиши билан белгиланади.

1. 
   ПЕПТИД БОГИНИНГ ТУЗИЛИШИ
   

Пептид богидаги карбоксил гурухининг углерод атоми sp²-гибридланиш холида булади, азот атомидаги булинмаган электрон булути С=О гурухининг П-электронлари билан таъсирлашган 3 та марказли система хосил булади ва унда электрон булут электроманфийлиги катта элемент томон силжийди.
Бу уз навбатида атомлараро бог узунлигини узгартиради. С=О бог узунлиги 0,121 дан 0,124 Нм гача узаяди; С-N бог узунлиги эса 0,147 Нм дан то 0,132 Нм гача камаяди.
0,132Нм Н
С N Н⁺
0 ,124 О  С=N
О
Пептид боги ясси тузилишга эга булиб 1 сатх текисликда етади, окибатда C-N боги конформация булиш табиатига эга булмай колади. Пептид богининг бундай тузилиши ва аминокислоталар радикалларининг узаро транс холатда жойлашганлиги уларнинг узаро мумкин кадар узокда жойлашувини таъминлайди.

2. 
   -СПИРАЛ ТУЗИЛИШИ.
   

Оксилларнинг бундай тузилиши улардаги аминокислоталар колдикларининг Н-богининг хосил килиш табиати оркали шаклланади.
-спирал конформациясининг баркарорлашуви хар бир 5 та аминокислотанинг колдиклари орасида Н-боглар шаклланиши келиб чикади.
H O H O
   
N H-CH-C-N-CH-C-N-CH-C-N-CH-C-N-CH-C-…
        
R^ O R² H R₃ O R₄ R₅ O

Бу боглар -спирал укига нисбатан деярли параллел йуналган булади.