Molekulyar dinamika
Molekulyar dinamika molekulalarning harakatini mikrodarajada modellash orqali ma‘lum birikmalarning fizikaviy makroxarakteristikalarini aniqlash
imkonini bermoqda. Makroxarakteristikalar - molekulalarning ma‘lum vaqt davomida fazodagi harakati natijasida qoldirgan izi, ya‘ni trayektoriyasini qayd qilish orqali aniqlanadi.
Molekulyar dinamikada zarrachalarning harakati (dinamikasi) Nyuton qonunlari bilan ifodalashnadi (F=ma, F=-F). Atomlarning harakatini modellashtirish jarayonida har bir atomga ta‘sir qiluvchi kuch (F) quyidagicha topilishi mumkin: F i = dU/ dr
Umumiy energiya kinetik (K) va potensial (U) energiya yig‘indisidan
aniqlanadi. Potensial energiya MM usuludagi umumiy energiyani toppish
formulasidan, yani: U=Е bog‘ +Е vb +Е tb +Е VdV +Е Kulon topiladi. Kinetik energiya quyidagi ifoda yordamida hisoblanadi:
Zarrachalarning ma‘lum bir vaqt ichidagi harakatining (trayektoriyasining) sanoqli yechimini topish uchun funksiyalarni Taylor qatoriga yoyish kabi
amaliyotlaridan foydalaniladi. Zarrachaning x o‘qi bo‘yicha dastlabki (t vaqtdagi) holati va tezligini x(t+Δt) yordamida x(t+2Δt) aniqlanishi mumkin. Xuddi shuningdek, dastlabki tezlik v(t) yordamida keyingi qadamdagi tezlik v(t+Δt) aniqlanishi mumkin.
javob:
MaSK interfeysi Gamess programmasi uchun birikma geometriyasini chizish yo‘li bilan input fayl tuzish imkoniyatiga ega. Yuklab olish va o‘rnatish mumkin (bepul). Birikma geometriyasini chizish uchun avvalo ―++‖ (Add atoms or groups of atoms) belgi va kerakli atom tanlanadi. Keyingi atom tanlangandan keyin ―++‖ oldingi atom ustiga bosiladi va programmaning o‘zi kimyoviy bog‘ hosil qiladi. Masalan, ―++‖ bilan H atomi tanlanib, oldingi C atomi ustiga bosilsa C-H bog‘i hosil bo‘ladi. Shu amal yana takrorlansa H-C-H guruhini hosil qiladi.
javob: Kvant-mexanikasining asosiy tenglamasi
Kvant-mexanika qoidalariga muvofiq, molekulaning tuziUshi va xususiyatlari uning to‘lqin funksiyalari(ᴪ) orqali aniqlanishi mumkin. To‘lqin funksiya kvant- mexanikasining asosiy tenglamasi hisoblangan Shredinger tenglamasi asosida hisoblab topilishi mumkin:
HΨ = EΨ (1)
Ma‘lumki, Shredinger tenglamasi faqat bir elektronli sistemalar (H, H2+ va He+ ) uchun yechimga ega.
Klassik mexanikada x o‘qi bo‘ylab xarakadanayotgan zarrachaning umumiy energiyasi E=T+U ifoda bilan topiladi. Kvant mexanikasida esa uning umumiy energiyasi gamiltonian operatori (H) yordamida aniqlanadi:
bu yerda, LT-potensial energiya bo‘lib, klassik mexanika va kvant mexanikasida z zaryadli zarrachaning yadro yaqinidagi potensial energiyasi –ze2r ifoda bilan aniqlanadi.
Shredinger tenglamasi ko‘p elektronli sistemalar uchun bir necha yondoshuvlar asosida yechiladi:
Do'stlaringiz bilan baham: |