47
xulosaga olib keldi. Bu fikr ferment molekulasini fermentativ reaktsiyada
qatnashadigan aksari substrat molekulasiga nisbatan ancha katta o`lchamli
bo`lishidan ham kelib chiqadi. Binobarin, ferment – substrat kompleksining hosil
bo`lishida substrat molekulasi bilan bevosita aloqaga
fermentning peptid zanjiri
chegaralangan qismigina kirishi kerak. Fermentning faol markazi deb oqsil ferment
molekulasining substrat bilan birikishini, uning ximiyaviy o`zgarishini
ta’minlaydigan qismlariga aytiladi. Bunday ma’lum bir vazifani bajaradigan bir
qator qismlar oddiy va murakkab fermentlarning uchlamchi strukturasida bo`ladi.
Murakkab fermentlarning faol markazi tarkibiga kofaktorlar kiradi. To`rtlamchi
strukturaga ega oligomer fermentlarda faol markazlar soni subbirliklar soniga teng
bo`lishi mumkin.
Oddiy va murakkab fermentlarning uchlamchi qurilishida ma’lum bir
funktsiyani bajaruvchi maxsus markazlar mavjud.
Faol markaz ko`pincha ferment molekulasining yuzasida botiq yoki tirqish
ko`rinishidagi qismidir. Shakli bo`yicha faol markaz uning ichiga kiradigan
substrat molekulasiga komplementar - mos keladi.
Faol markaz fermentning
spesifikligini va katalitik faolligini ta’minlaydigan, fazoda ma’lum ravishda
orientasiyalangan bir qator funksional guruhlardan iborat. Ular orasida substratga
yaqinlikni, ya’ni spesifik bog`lanishni ta’minlaydigan kontakt yoki aloqa qismi
hamda substratni ximiyaviy o`zgarishini ta’minlaydigan katalitik faol markaz farq
qilinadi. Odatda fermentning faol markazini polipeptid zanjirning 12-16 ta
aminokislota qoldiqlari tashkil qiladi. Faol markazni tashkil etadigan
aminokislotalar polipeptid zanjirning fazoviy
taxlanishida ular yaqinlashib, faol
markazni tashkil etadi. Bundan fermentativ faollik uchun polipeptid zanjir qolgan
qismining zarurligi yo`q, degan xulosani chiqarish kerak emas, chunki
molekulaning boshqa qismlari faol markazning fazoda uch o`lchovli
konfigurasiyasini belgilab, guruhlarning reaktsiya qobiliyatini ta’minlaydi.
Oddiy fermentlarda faol markazning aloqa va katalitik qismlarining
funksional guruhlari vazifasini aminokislotalarning faqat yon radikallari bajaradi.
Murakkab fermentlarda esa bu jarayonlardagi asosiy vazifani kofaktorlar bajaradi.
Kataliz jarayonida fermentlarning quyidagi funksional guruhlari ishtirok
etadilar:
dikarbon aminokislotalarning COOH va
polipeptid zanjirning uchki
COOH guruhlari;
lizin va polipeptid zanjirning NH
2
guruhi;
argininning guanidin guruhi;
triptofanning indol guruhi;
gistidinning imidazol guruhi;
serin va treoninning OH guruhi;
sisteinning SH va sistinning disulfid guruhi;
metioninning tioefir guruhi;
tirozinning fenol guruhi;
alifatik aminokislotalarning gidrofob zanjiri va fenilalaninning aromatik
halqasi.
48
Polipeptid zanjirning sanab o`tilgan aminokislota
qoldiqlarini fizik-
ximiyaviy xossalari mos keladigan substrat bilan aloqani belgilaydi.
Aminokislotalarning gidrofob radikallari substratning qutbsiz qismlariga mos
keladi. Qutbli guruhlar esa kislotali yoki ishqoriy xossalarga ega bo`ladi. Muhit
pH ining o`zgarishi ularning kislota-asosli xossalarini o`zgartiradi va substratning
turli xil guruhlari bilan aloqasiga olib keladi.
Murakkab fermentlarning faol markazidagi aminokislotalarning yon
radikallari faol markazning to`g`ri konformatsiyasi uchun sharoit yaratadi va
kofaktorlarga bog`lanishda, orientasiyada hamda o`z
navbatida substratning
o`zgarishida yordam beradi.
Ferment molekulasida faol markazdan tashqari allosterik ( grekcha allos –
boshqa, yot va steros – fazoga, strukturaga oid) markaz ham bo`lishi mumkin. U
ferment molekulasida fazoviy jihatdan faol markazdan ajralgan holda bo`ladi.
Allosterik markaz bilan bog`lanuvchi molekulalar tuzilishiga ko`ra substratga
o`xshamaydigan, lekin faol markazda uning konfiguratsiyasini o`zgartirgan holda
substratning bog`lanishi va o`zgarishiga ta’sir etadigan markaz tushuniladi.
Ferment molekulasi bir nechta allosterik markazlarga ega bo`lishi mumkin.
Allosterik markaz bilan bog`lanuvchi moddalar allosterik effekrorlar deb ataladi.
Allosterik markazga effektorlarning birikishi ferment molekulasining uchlamchi,
ba’zan to`rtlamchi strukturasini va unga muvofiq ravishda faol markazning
konfigurasiyasini o`zgartirib, enzimatik faollikni kuchayishi yoki pasayishiga olib
keladi. Shunga mos ravishda allosterik effektorlar ijobiy (aktivatorlar) yoki salbiy
(ingibitorlar) deb ataladi.
Allosterik fermentlar odatda oligomer tuzilishga ega bo`lib,
bir-biridan
ma’lum masofada joylashgan bir nechta faol markaz va bir nechta allosterik
boshqaruvchi markazga ega bo`ladilar.
Do'stlaringiz bilan baham: