Odamidur ilmu donish birla odam, yôq esa, Odamidur ilmu donish birla odam, yôq esa



Download 6,54 Mb.
bet8/16
Sana29.05.2022
Hajmi6,54 Mb.
#616142
1   ...   4   5   6   7   8   9   10   11   ...   16
Bog'liq
Hosilbekov Jasurbek va Umirzakov Samandarning Genomika fanidan tayyorlagan mustaqil ishi

Fitch-Margoliash usuli Fitch-Margoliash usuli genetik masofaga asoslangan klasterlash uchun eng kichik kvadratlar usulidan foydalanadi. Daraxt qurish jarayonida uzoqdan bogʻlangan ketma-ketliklar orasidagi masofani oʻlchashdagi noaniqlikni toʻgʻirlash uchun yaqindan bogʻliq ketma-ketliklarga koʻproq ogʻirlik beriladi. Algoritmga kirish sifatida foydalaniladigan masofa bir-biriga yaqin va uzoqdan bog'langan guruhlar o'rtasidagi hisoblash munosabatlarida katta artefaktlarning oldini olish uchun normallashtirilishi kerak. Shu tarzda hisoblangan masofalar chiziqli bo'lishi kerak. Masofa uchun chiziqlilik mezoni shundan iboratki, ikkita alohida filial uchun filial uzunligining kutilayotgan qiymati ikki masofa yig'indisining kutilgan qiymatiga teng bo'lishi kerak. Bu xususiyat biologik ketma-ketliklarga faqat individual saytlar teskari mutatsiya ehtimoli uchun tuzatilgan taqdirdagina qo'llaniladi. Ushbu modifikatsiya DNK evolyutsiyasining Jukes-Cantor modelidan olinganlar kabi almashtirish matritsalari yordamida amalga oshiriladi.

  • Fitch-Margoliash usuli Fitch-Margoliash usuli genetik masofaga asoslangan klasterlash uchun eng kichik kvadratlar usulidan foydalanadi. Daraxt qurish jarayonida uzoqdan bogʻlangan ketma-ketliklar orasidagi masofani oʻlchashdagi noaniqlikni toʻgʻirlash uchun yaqindan bogʻliq ketma-ketliklarga koʻproq ogʻirlik beriladi. Algoritmga kirish sifatida foydalaniladigan masofa bir-biriga yaqin va uzoqdan bog'langan guruhlar o'rtasidagi hisoblash munosabatlarida katta artefaktlarning oldini olish uchun normallashtirilishi kerak. Shu tarzda hisoblangan masofalar chiziqli bo'lishi kerak. Masofa uchun chiziqlilik mezoni shundan iboratki, ikkita alohida filial uchun filial uzunligining kutilayotgan qiymati ikki masofa yig'indisining kutilgan qiymatiga teng bo'lishi kerak. Bu xususiyat biologik ketma-ketliklarga faqat individual saytlar teskari mutatsiya ehtimoli uchun tuzatilgan taqdirdagina qo'llaniladi. Ushbu modifikatsiya DNK evolyutsiyasining Jukes-Cantor modelidan olinganlar kabi almashtirish matritsalari yordamida amalga oshiriladi.
  • Masofaviy tuzatish faqat evolyutsiya tezligi filialdan filialga o'zgarib tursagina kerak bo'ladi. Algoritmning yana bir modifikatsiyasi, ayniqsa fokuslangan masofalar uchun foydali boʻlishi mumkin (oʻlchov konsentratsiyasi fenomeni va oʻlchovlarning laʼnati boʻyicha hisobot): da tavsiflangan oʻzgartirishlar algoritmning samaradorligi va mustahkamligini oshirishga qaratilgan. Ushbu masofalarga qo'llaniladigan eng kichik kvadratlar mezoni qo'shni birlashma usulidan ko'ra aniqroq, ammo unchalik samarali emas. Ma'lumotlar to'plamidagi bir-biriga chambarchas bog'liq bo'lgan ko'plab ketma-ketliklarda yuzaga keladigan masofalar orasidagi korrelyatsiyalarni tuzatish uchun qo'shimcha yaxshilanishlar hisoblash xarajatlarini oshirishda ham qo'llanilishi mumkin. Barcha tuzatish omillaridan foydalangan holda optimal eng kichik kvadratlar daraxtini topish NP-to'liq bo'lgani uchun, daraxt bo'shlig'i orqali qidirishda maksimal passimoniya tahlilida qo'llaniladigan bir xil evristik qidiruv usuli qo'llaniladi.

Download 6,54 Mb.

Do'stlaringiz bilan baham:
1   ...   4   5   6   7   8   9   10   11   ...   16




Ma'lumotlar bazasi mualliflik huquqi bilan himoyalangan ©hozir.org 2024
ma'muriyatiga murojaat qiling

kiriting | ro'yxatdan o'tish
    Bosh sahifa
юртда тантана
Боғда битган
Бугун юртда
Эшитганлар жилманглар
Эшитмадим деманглар
битган бодомлар
Yangiariq tumani
qitish marakazi
Raqamli texnologiyalar
ilishida muhokamadan
tasdiqqa tavsiya
tavsiya etilgan
iqtisodiyot kafedrasi
steiermarkischen landesregierung
asarlaringizni yuboring
o'zingizning asarlaringizni
Iltimos faqat
faqat o'zingizning
steierm rkischen
landesregierung fachabteilung
rkischen landesregierung
hamshira loyihasi
loyihasi mavsum
faolyatining oqibatlari
asosiy adabiyotlar
fakulteti ahborot
ahborot havfsizligi
havfsizligi kafedrasi
fanidan bo’yicha
fakulteti iqtisodiyot
boshqaruv fakulteti
chiqarishda boshqaruv
ishlab chiqarishda
iqtisodiyot fakultet
multiservis tarmoqlari
fanidan asosiy
Uzbek fanidan
mavzulari potok
asosidagi multiservis
'aliyyil a'ziym
billahil 'aliyyil
illaa billahil
quvvata illaa
falah' deganida
Kompyuter savodxonligi
bo’yicha mustaqil
'alal falah'
Hayya 'alal
'alas soloh
Hayya 'alas
mavsum boyicha


yuklab olish