1. Genomlar organizmning chizmalari sifatida Genomlar ketma -ketligini aniqlash

ODAM Immun tanqisligi viruslari (RETROVIRIDAE) | Molekulyar biologiya
Leon F. Garsiya-Martinez, J. Viktor Garsiya-Martinez, Virusologiya ensiklopediyasida (Ikkinchi nashr), 1999 y.
Genom tuzilishi
OIV genomasi sichqon retroviruslari genomiga qaraganda ancha murakkab (1 -rasm). Bu murakkablik, ehtimol, bu virus va uning xosti o'rtasidagi dinamik o'zaro ta'sirni aks ettiradi. Boshqa barcha retroviruslar singari, OIV genomida ham uchta tizimli gen kodlangan gag, pol va env. Bundan tashqari, u bir nechta kichik genlarni kodlaydi (vif, vpr/vpx, tat, rev, vpu va nef) genlar ifodasini, oqsil ifodasini tartibga soluvchi va katta darajada virulentlik determinantlari hisoblanadi. O'zining kodlash qobiliyatini maksimal darajada oshirish uchun OIV ma'lumotni nisbatan kichik genomga to'plash uchun bir necha xil vositalardan foydalanadi. Virusli genomning differentsial biriktirilishi tizimli va tartibga soluvchi genlarning ifodasini vaqtincha va foydali tarzda nazorat qilish uchun ishlatiladi. Bundan tashqari, virus genomi bir nechta kodlaydi cis-virionni qadoqlash (r yoki psi), teskari transkripsiya (primerni bog'lash joyi yoki PBS, polipurin traktlari yoki PPT), yadroda RNKni ushlab turish (salbiy tartibga soluvchi elementlar yoki CRS), RNKni eksport qilish va qayta ishlash (Revga javob beruvchi element) yoki RRE va poliadenilatsiyali signal), transkripsiya (TAR) va boshqalar.

1 -rasm. OIV-1 genomining diagrammasi.

Evolyutsion genomikaga kirish
Ushbu kitob evolyutsion genomikaning asoslarini tushuntirib beradigan birinchi turdagi kitobdir. Keng qamrovli qamrov turli xil genom tashkilotlarining qisqacha tavsiflarini, ishlatilgan usullarni batafsil muhokama qilishni va genom ketma -ketligini qayta ishlash tartiblarini batafsil ko'rib chiqishni o'z ichiga oladi. Dastlabki boblar, shuningdek, evolyutsion tadqiqotlar bilan tanish bo'lmagan o'quvchilar uchun zarur asoslarni taqdim etadi. Xususiyatlar: molekulyar biologiya, DNK replikatsiyasi, mutatsiya, filogeniya, neytral evolyutsiya asoslari bilan tanishtiradi va tabiiy tanlanish hayotning qisqacha evolyutsion tarixini, dastlabki dengizlardan odamlarning paydo bo'lishigacha, prokaryotlar, eukaryotlar, umurtqali hayvonlar va odamlarning genomlarini tasvirlaydi. genomlar ketma-ketligi, fenotip ma'lumotlarini yig'ish, homologiyani qidirish va tahlil qilish usullarini ko'rib chiqadi va filogenetik daraxt va tarmoq qurilishi genom ketma-ketliklari va tegishli ma'lumotlarning ma'lumotlar bazalarini, evolyutsion masofalarni muhokama qiladi va populyatsiya genomikasi tegishli veb-saytda qo'shimcha materiallarni taqdim etadi.