Эволюция вирусов

Mononegavirales
. Более того, при этом способе организации генома, порядок
генов, по-видимому, зависит от требуемого количества белкового продукта этих генов,
так что первые гены расположенные ближе к 3’-концу кодируют белки 
нуклеокапсида
, а
гены расположенные на 5’-конце, кодируют РНК-полимеразу. Это подтверждает
предположение, что это адаптация для облегчения контроля экспрессии генов.
См. также

---

ДНК-содержащие вирусы
РНК-содержащие вирусы
1. Mahy, p. 25
2. Mahy, p. 26
3. Dimmock, N.J. 
Introduction to Modern Virology (https://archive.org/details/introductiontomo
00dimm_306)
 
(неопр.)
. — 
Blackwell Publishing
, 2007. — С. 
16 (https://archive.org/details/in
troductiontomo00dimm_306/page/n258)
. — 
ISBN 1-4051-3645-6
.
4. Leppard, p. 16
5. Sussman, p. 11
. Mahy, p. 24
7. Sussman, pp. 11-12
. Villarreal, L.P. Viruses and the Evolution of Life. ASM Press, 2005. 
ISBN 978-1555813093
.
9. Mahy, pp. 362-78
10. Forterre P. Giant viruses: conflicts in revisiting the virus concept 
(англ.)
 // 
Intervirology
 :
journal. — 2010. — June (vol. 53, no. 5). — P. 362—378. — 
doi
:
10.1159/000312921 (https://d
x.doi.org/10.1159%2F000312921)
. — 
PMID 20551688
.
11. Forterre P., Krupovic M. The origin of virions and virocells: the Escape hypothesis
revisited 
(англ.)
 // Viruses: Essential Agents of Life : journal / G. Witzany. — Springer
Science+Business Media Dordrecht, Netherlands, 2012. — P. 43—60. — 
doi
:
10.1007/978-94-
007-4899-6_3 (https://dx.doi.org/10.1007%2F978-94-007-4899-6_3)
.
12. Anshan Nasir and Gustavo Caetano-Anollés, «A phylogenomic data-driven exploration of viral
origins and evolution» (Science Advances, Vol 1, No. 8, 04 September 2015)
13. Emerman M., Malik H. S. 
Paleovirology—modern consequences of ancient viruses (http://dx.p
los.org/10.1371/journal.pbio.1000301)
 
(англ.)
 // 
PLoS Biology
 : journal / Virgin, Skip W.. —
2010. — February (vol. 8, no. 2). — P. e1000301. — 
doi
:
10.1371/journal.pbio.1000301 (https://
dx.doi.org/10.1371%2Fjournal.pbio.1000301)
. — 
PMID 20161719
.
Примечания

---

14. Lam T. T., Hon C. C., Tang J. W. Use of phylogenetics in the molecular epidemiology and
evolutionary studies of viral infections 
(англ.)
 // 
Critical Reviews in Clinical Laboratory
Sciences
 : journal. — 2010. — February (vol. 47, no. 1). — P. 5—49. —
doi
:
10.3109/10408361003633318
(https://dx.doi.org/10.3109%2F10408361003633318)
. — 
PMID 20367503
.
15. Leppard, p. 273.
1 . Leppard, p. 272.
17. Domingo E., Escarmís C., Sevilla N., Moya A., Elena S. F., Quer J., Novella I. S., Holland J. J.
Basic concepts in RNA virus evolution 
(англ.)
 // 
The FASEB Journal
 : journal. — 
Federation of
American Societies for Experimental Biology
, 1996. — June (vol. 10, no. 8). — P. 859—864. —
PMID 8666162
.
1 . Boutwell C. L., Rolland M. M., Herbeck J. T., Mullins J. I., Allen T. M. Viral evolution and
escape during acute HIV-1 infection 
(англ.)
 // 
The Journal of Infectious Diseases
 : journal. —
2010. — October (vol. 202, no. Suppl 2). — P. S309—S314. — 
doi
:
10.1086/655653 (https://dx.
doi.org/10.1086%2F655653)
. — 
PMID 20846038
.
19. Chen J., Deng Y. M. Influenza virus antigenic variation, host antibody production and new
approach to control epidemics 
(англ.)
 // 
Virology Journal
 : journal. — 2009. — Vol. 6. —
P. 30. — 
doi
:
10.1186/1743-422X-6-30 (https://dx.doi.org/10.1186%2F1743-422X-6-30)
. —
PMID 19284639
.
20. Fraile A., García-Arenal F. The coevolution of plants and viruses: resistance and
pathogenicity 
(англ.)
 // Advances in Virus Research : journal. — 2010. — Vol. 76. — P. 1—32. —
ISBN 9780123745255
. — 
doi
:
10.1016/S0065-3527(10)76001-2 (https://dx.doi.org/10.1016%
2FS0065-3527%2810%2976001-2)
. — 
PMID 20965070
.
21. Tang J. W., Shetty N., Lam T. T., Hon K. L. Emerging, novel, and known influenza virus
infections in humans 
(англ.)
 // Infectious Disease Clinics of North America : journal. —
2010. — September (vol. 24, no. 3). — P. 603—617. — 
doi
:
10.1016/j.idc.2010.04.001 (https://d
x.doi.org/10.1016%2Fj.idc.2010.04.001)
. — 
PMID 20674794
.
22. Mahy, pp. 706—80.
23. Barrett, p. 16.
24. Barrett, p. 246—25.
25. 
Holmes E.C., 2013
, p. 305.

---

Barrett, Thomas C; Pastoret, Paul-Pierre; Taylor, William J. Rinderpest and peste des petits
ruminants: virus plagues of large and small ruminants 
(неопр.)
. — Amsterdam: 
Elsevier Academic
Press
, 2006. — 
ISBN 0-12-088385-6
.
Leppard, Keith; Nigel Dimmock; Easton, Andrew. Introduction to Modern Virology 
(неопр.)
. —
Blackwell Publishing Limited
, 2007. — 
ISBN 1-4051-3645-6
.
2 . Arslan D., Legendre M., Seltzer V., et al. Distant mimivirus relative with a larger genome
highlights the fundamental features of Megaviridae. 
(англ.)
 // Proc Natl Acad Sci U S A :
journal. — 2011. — Vol. 108. — P. 17486—17491.
27. Holmes E.C. The Evolution and Emergence of RNA Viruses. 
(англ.)
 // Oxford University Press, :
journal. — 2009.
2 . Zhang Z., Kottadiel V.I., Vafabakhsh R., et al. A promiscuous DNA packaging machine from
bacteriophage T4. 
(англ.)
 // PLoS Biol : journal. — 2011. — Vol. 9. — P. e1000592.
29. Iyer L.M., Balaji S., Koonin E.V., et al. Evolutionary genomics of nucleocytoplasmic large DNA
viruses. 
(англ.)
 // Virus Res. : journal. — 2006. — Vol. 117. — P. 156—184.
30. Reanney D.C. The evolution of RNA viruses. 
(англ.)
 // Annu. Rev. Microbiol. : journal. —
1982. — Vol. 36. — P. 47—73.
31. Gorbalenya A.E., Koonin E.V. Viral proteins containing the purine NTPbinding sequence
pattern. 
(англ.)
 // Nucl. Acids Res. : journal. — 1989. — Vol. 17. — P. 8413—8440.
32. Gorbalenya A. E., Enjuanes L., Ziebuhr J., et al. Nidovirales: evolving the largest RNA virus
genome 
(англ.)
 // Virus Res. : journal. — 2006. — Vol. 117. — P. 17—37.
33. Minskaia E., Hertzig T., Gorbalenya A. E., et al. Discovery of an RNA virus 39->59
exoribonuclease that is critically involved in coronavirus RNA synthesis. 
(англ.)
 // Proc Natl
Acad Sci USA : journal. — 2006. — Vol. 103. — P. 5108—5113.
34. Belshaw R., Pybus O. G., Rambaut A. The evolution of genome compression in RNA
viruses. 
(англ.)
 // Genome Res. : journal. — 2007. — Vol. 17. — P. 1496—1504.
35. 
Simon-Loriere, 2011
.
3 . 
Nee, 1987
.
37. 
Holmes, 2009
.
Литература

---