|
.
Reja:
1 Satellitlar DNK ning takrorlanadigan, kodlanmaydigan DNKning juda katta massivlaridan iborat . Satellitlar DNKning funktsional sentromerlarning asosiy komponenti bo’lib, geteroxromatinning asosiy tarkibiy tarkibiy qismini tashkil qiladi . - “Satellit DNK” nomi qisqa DNK ketma-ketligining takrorlanishi adenin , sitozin , guanin va timin asoslarining boshqa chastotasini ishlab chiqarishga moyil bo’lgan hodisani anglatadi va shuning uchun ular ikkinchi yoki ikkinchisini hosil qiladigan DNK massasidan farqli zichlikka ega. Genomik DNK zichlik gradienti bo’yicha ajratilganda “satellitlar” bandi . [2] A+T nisbati kattaroq boʻlgan ketma-ketliklar pastroq zichlikni, G+C nisbati kattaroq boʻlganlar esa genomik DNKning asosiy qismiga nisbatan yuqoriroq zichlikni koʻrsatadi. Ba’zi takrorlanuvchi ketma-ketliklar ~ 50% G+C/A+T ni tashkil qiladi va shuning uchun ko’chma zichliklari ommaviy genomik DNK bilan bir xil. Ushbu satellitlar “sirli” satellitlar deb ataladi, chunki ular genomik DNKning asosiy bandida yashiringan chiziq hosil qiladi. “Izopiknik” – bu sirli sun’iy
. 1 - Satellit DNK eukaryotik genomning takrorlanuvchi fraktsiyasining eng qiziqarli qismlaridan birini ifodalaydi. 1960-yillarda juda koʻp takrorlanuvchi tandem DNKsi kashf etilganidan beri koʻplab adabiyotlar bunday ketma-ketliklarning tuzilishi, tashkil etilishi, funktsiyasi va evolyutsiyasi bilan bogʻliq turli mavzularni keng yoritgan. Bugungi kunda genomik vositalar paydo bo’lishi bilan sun’iy yo’ldosh DNKsini o’rganish yana katta qiziqish uyg’otdi. Shunday qilib, Keyingi avlod ketma-ketligi (NGS) NGS o’qishlarida mavjud bo’lgan ma’lumotlarni silika tahlilida yuqori o’tkazuvchanlik bilan birga eukaryotik genomlarning takrorlanuvchi qismini tahlil qilishda inqilob qildi. Mavzuga barcha tarixiy va joriy yondashuvlar bizga sun’iy yo’ldosh DNKning funktsiyasi va evolyutsiyasi va uning xromosoma evolyutsiyasidagi roli haqida keng ma’lumot beradi. Hozirda, Biz sun’iy yo’ldosh DNKsining evolyutsion taqdiriga ta’sir etuvchi molekulyar, xromosoma, biologik va populyatsiya omillari, sun’iy yo’ldoshning kelib chiqishi, tarqalishi va evolyutsiyasi haqida bir-biriga mos keladigan bir qator gipotezalarni keltirib chiqaradigan bilimlar haqida keng ma’lumotlarga egamiz. DNK. Ushbu maqolada men ushbu gipotezalarni metodologik, kontseptual va tarixiy nuqtai nazardan ko’rib chiqaman va ularni xromosomalarning tuzilishi va evolyutsiyasi kontekstida tuzaman
. 2 Molekulyar genetikada minisatellit takrorlanuvchi DNK bo’lagi bo’lib , unda ma’lum DNK motivlari (uzunligi 10 dan 60 ta asosiy juftgacha ) odatda 5 dan 50 martagacha takrorlanadi. Minisatellitlar inson genomidagi 1000 dan ortiq joylarda topilgan va yuqori mutatsiya tezligi va yuqori populyatsiya xilma-xilligi bilan ajralib turadi . Minisatellitlar xromosomalarning sentromera va telomerlarida ko’zga tashlanadi ., ikkinchisi xromosomalarni shikastlanishdan himoya qiladi. “Sun’iy yo’ldosh” nomi probirkadagi genomik DNKni sentrifugalash DNKning asosiy qatlamini takrorlanuvchi DNKning “sun’iy yo’ldosh” qatlamlaridan ajratishini dastlabki kuzatishni anglatadi. Minisatellitlar kichik DNK ketma-ketligi bo’lib, ular oqsillarni kodlamaydi , lekin genomda yuzlab marta uchraydi , ko’p nusxalari yonma-yon takrorlanadi. - Minisatellitlar va ularning qisqaroq qarindoshlari, mikrosatellitlar birgalikda VNTR ( tandem takrorining o’zgaruvchan soni ) DNK sifatida tasniflanadi . Ajablanarlisi shundaki, mini yo’ldoshlar ko’pincha VNTR deb ataladi va mikrosatellitlar ko’pincha qisqa tandem takrorlari (STR) yoki oddiy ketma-ketlik takrorlari (SSR) deb ataladi.
. 2 - MINISATELITLAR: Tengsiz almashinuv kabi keng ko’lamli mexanizmlar orqali rivojlaning. Mikrosatellitlar singari ular takrorlanish birligida rivojlanadi. Ular VNTR (o’zgaruvchan nukleotid tandem takrorlari) deb ham ataladi. Genlar ichida yoki genlar orasida joylashgan, takroriy birliklar kichik (50 > 200 bp), har bir ketma-ketlikning tandem nusxalari soni har bir shaxsga qarab o’zgaradi, takroriy birliklar yaxshi mos kelmasa, genetik rekombinatsiya paytida variatsiya hosil bo’ladi, ular genetik almashinuvning yuqori sur’atlarini taqdim etadi.(rekombinatsiya paytida tez-tez saytlar), ular marker sifatida ishlatiladi va genetik barmoq izining asosi hisoblanadi.
. 3 Molekulyar genetikada mikrosatellitlar ( ingliz tilidagi qisqartmalar uchun SSR yoki STR oddiy ketma-ketlikni takrorlash va qisqa tandem takrorlash uchun) DNK ketma-ketliklari bo’lib, unda fragment (o’lchami ikkidan oltita asosiy juftlik oralig’ida) ketma-ket takrorlanadi. Takroriy ketma-ketlik emas, balki takrorlanish sonining o’zgarishi turli xil allellarni hosil qiladi . - Ular odatda DNKning kodlanmagan joylarida topiladi. Ular neytral, ko-dominant va yuqori mutatsiya tezligiga ega , bu ularni juda polimorf qiladi. Ular munosabatlar va populyatsiyani o’rganish kabi genetika sohasidagi turli xil ilovalarda molekulyar belgilar sifatida ishlatiladi . Bu shaxsiy genetik barmoq izini yoki genetik profilni yaratish qobiliyati bilan bog’liq.
. 3 - Shuni ta’kidlash kerakki, genomda topishimiz mumkin bo’lgan har bir STR uchun populyatsiyada takrorlanishlar sonining chastotalari belgilanadi, ya’ni har bir STR uchun “normal” takrorlanishlar sonining ma’lum diapazoni mavjud. Populyatsiya ichida (masalan, ma’lum bir STR uchun 10 dan 13 gacha takrorlash), shu bilan birga, ushbu markerda kamroq o’rnatiladigan boshqa takrorlash raqamlari mavjud.
.
Eʼtiboringiz uchun rahmat
Do'stlaringiz bilan baham: |
