Dan ma'lumot olish jarayoni

mRNKni qayta ishlash
Asosiy maqola: Transkripsiyadan keyingi modifikatsiya
Prokaryotik oqsillarni kodlovchi genlarning transkripsiyasi hosil bo'ladi xabarchi RNK (mRNA) oqsilga tarjima qilishga tayyor, ökaryotik genlarning transkripsiyasi a asosiy transkript RNK (oldingi RNK), bu birinchi navbatda etuk RNKga aylanish uchun bir qator modifikatsiyadan o'tishi kerak. Pishib etish jarayonlarida ishtirok etadigan turlar va bosqichlar kodlash va kodlamaydigan preRNKlar orasida farq qiladi; ya'ni ham mRNK uchun ham preRNK molekulalari bo'lsa ham tRNK qo'shilishdan o'tadi, qadamlar va mexanizmlar boshqacha.^[8] Kodlamaydigan RNKni qayta ishlash quyida tavsiflangan (yadrosiz RNK pishib etish).
PremRNKni qayta ishlash 5 include ni o'z ichiga oladi yopilish, qo'shadigan fermentativ reaktsiyalar to'plami 7-metilguanozin (m⁷G) pre-mRNKning 5 ′ oxirigacha va shu bilan RNKni degradatsiyadan saqlaydi ekzonukleazalar. M⁷Keyin G qopqog'i bog'langan qopqoqni bog'lash kompleksi mRNKning sitoplazma eksportiga yordam beradigan va shuningdek, RNKni parchalanishdan saqlaydigan heterodimer (CBC20 / CBC80).
Boshqa modifikatsiya - 3 ′ dekolte va poliadenilatsiya. Ular oldindan mRNKda poliadenilatsiya signallari ketma-ketligi (5′- AAUAAA-3 ′) mavjud bo'lsa, ular paydo bo'ladi, bu odatda oqsillarni kodlash ketma-ketligi va terminator o'rtasida bo'ladi. Oldin mRNK ajratilib, so'ngra ~ 200 adenin (A) qatori qo'shilib, RNKni parchalanishidan saqlaydigan poli (A) dum hosil qiladi. Poli (A) quyruq ko'plik bilan bog'langan poli (A) bog'laydigan oqsillar (PABP) mRNA eksporti va tarjimani qayta boshlash uchun zarur. Deedenilatsiyaning teskari jarayonida poli (A) dumlari qisqaradi CCR4-emas 3′-5 ′ ekzonukleaza, bu ko'pincha transkriptning to'liq parchalanishiga olib keladi.

Eukaryotik pre-mRNKning juda muhim modifikatsiyasi RNK qo'shilishi. Eukaryotik pre-mRNKlarning aksariyati o'zgaruvchan segmentlardan iborat exons va intronlar. Birlashtirish jarayonida RNK-protein katalitik kompleksi sifatida tanilgan splitseozoma ikkita transesterifikatsiya reaktsiyasini katalizlaydi, ular intronni olib tashlaydi va lariat tuzilishi shaklida chiqaradi, so'ngra qo'shni ekzonlarni birlashtiradi. Ba'zi hollarda ba'zi intronlar yoki ekzonlar olinishi yoki etuk mRNKda saqlanib qolishi mumkin. Bu shunday deb nomlangan muqobil qo'shish bitta gendan kelib chiqqan turli xil transkriptlarning bir qatorini yaratadi. Ushbu transkriptlar potentsial ravishda turli xil oqsillarga tarjima qilinishi mumkinligi sababli, splichka evkaryotik gen ekspressionining murakkabligini va tur hajmini kengaytiradi proteom.

Keng RNKni qayta ishlash an bo'lishi mumkin evolyutsion ustunlik eukaryotlarning yadrosi tufayli mumkin bo'ldi. Prokaryotlarda transkripsiya va tarjima birgalikda sodir bo'ladi, eukaryotlarda esa yadro membranasi RNK bilan ishlov berish uchun vaqt berib, ikkita jarayonni ajratib turadi.

Ko'pgina organizmlarda kodlamaydigan genlar (ncRNA) keyingi ishlov beriladigan prekursorlar sifatida yoziladi. Ribosoma RNKlari (rRNK) holatida ular ko'pincha bir yoki bir nechta rRNKlarni o'z ichiga olgan pre-rRNK sifatida transkripsiyalanadilar. Pre-RRNK ajralgan va o'zgartirilgan (2 (-O-metillanish va pseudouridin shakllanishi) ma'lum joylarda taxminan 150 xil nukleol cheklangan RNK turlari tomonidan snoRNAlar deb nomlanadi. SnoRNAlar oqsillar bilan birikib, snoRNP hosil qiladi. SnoRNA qismi maqsadli RNK bilan birlashganda va shu bilan modifikatsiyani aniq joyda joylashtirganda, oqsil qismi katalitik reaktsiyani amalga oshiradi. Eukaryotlarda, xususan RNase deb nomlangan snoRNPda MRP 45S oldingi rRNKni 28S, 5.8S va 18S rRNKlariga ajratadi. RRNK va RNKni qayta ishlash omillari katta agregatlarni hosil qiladi nukleus.^[9]

Masalan, transfer RNK (tRNK) holatida 5 p ketma-ketlik o'chiriladi RNase P,^[10] 3-uchi esa tomonidan o'chiriladi tRNase Z ferment^[11] va andozasiz 3 ′ CCA dumi a tomonidan qo'shiladi nukleotidil transferaza.^[12] Bo'lgan holatda mikro RNK (miRNK), miRNAlar dastlab birlamchi transkriptlar yoki pri-miRNK sifatida qopqoq va poli-A dum bilan transkripsiya qilinadi va fermentlar tomonidan hujayra yadrosidagi pre-miRNA deb nomlanuvchi qisqa, 70 nukleotidli ildiz-halqa tuzilmalariga ishlov beriladi. Drosha va Pasha. Eksport qilinganidan so'ng, u endonukleaza bilan o'zaro ta'sirlashib sitoplazmadagi etuk miRNKlarga ishlov beriladi. Dicer, bu ham shakllanishni boshlaydi RNK tomonidan induktsiya qilingan kompleks (RISC), dan tashkil topgan Argonaute oqsil.
Hatto snRNA va snoRNAlarning o'zi funktsional RNP kompleksining bir qismiga aylanishidan oldin bir qator modifikatsiyadan o'tadilar. Bu nukleoplazmada yoki maxsus bo'limlarda chaqiriladi Kajal jasadlari. Ularning asoslari bir guruh tomonidan metillangan yoki psevdouridinilatlangan tanaga xos bo'lgan kichik Kajal RNKlari (scaRNA), tuzilishi jihatidan snoRNAlarga o'xshash.