|
56
XIV Съезд Русского ботанического общества
Полученные последовательности участков ДНК депонированы в базе данных GenBank (номера до-
ступа с MF598092 по MF598158). Для
Ch. brevirostris
и
Ch. laticoronata
дополнительно провели муль-
тилокусный анализ с использованием ISSR маркеров в связи с неоднозначностью результатов, полу-
ченных при анализе региона ITS. В анализ были также включены
Ch. ambigua
и
Ch. juncea.
Структура
праймеров,
методы выделения, проведения ПЦР, получения ISSR маркеров и анализа полученных
данных подробно описаны в работе А.С. Кашина и др. (2017).
Выравнивание последовательностей ITS-спейсера состояло из 582 позиций, 14 из которых
были вариабельными (содержали замены). Так как у всех образцов
Ch. brevirostris
и
Ch. laticoronata,
а также некоторых образцов
Ch. canescens
и
Ch. juncea
наблюдались сдвоенные пики в нескольких
позициях последовательностей, в анализ включались дедуцированные последовательности обоих ал-
лелей.
В результате реконструкции наиболее вероятной сети ядерных гаплотипов была построена
одна сеть, объединяющая 30 гаплотипов, из которых 14 отсутствовали в нашей выборке и представ-
ляли собой гипотетические промежуточные гаплотипы. Всю сеть можно разделить на три равноуда-
ленных (автоматически рассчитанный предел наиболее экономной реконструкции в 6 мутаций) друг
от друга группы.
Корневую группу составляет
Ch. rouillieri
Kar. & Kir, произрастающая в Китае и загруженная
нами из базы данных GenBank (HQ436223.1, гаплотип 1). Шесть замен отделяют ее от гаплотипа 11
второй группы, обнаруженного у гербарного образца
Ch. piptocoma
. Этот гаплотип имеет в качестве
производных гаплотипы 12 и 16 и, кроме того, через один гипотетический гаплотип, минуя гаплоти-
пы 12 – 15, даёт производным один из промежуточных между группами 2 и 3 гипотетических гапло-
типов. Таким образом все гаплотипы второй группы, за исключением гаплотипа 16, образуют за-
мкнутую петлю, как следствие гомоплазии, что затрудняет интерпретацию гениалогических связей
между ними. Но при этом остаётся очевидным, что все гаплотипы третьей группы являются произ-
водными через серию гипотетических промежуточных гаплотипов от гаплотипов второй группы.
Гаплотип 16 объединяет в себе один из образцов
Ch. lejosperma
из Киргизии
и
Ch. phaeocephala
из
Таджикистана
,
не имея в пределах построенной сети производных гаплотипов. Довольно обширный
гаплотип 12 содержит в себе гербарный образец
Ch. ambigua
из Казахстана, второй образец
Ch.
lejosperma
из Киргизии,
Ch. bosseana
из Киргизии и по одной аллели образцов
Ch. laticoronata
из по-
пуляций Астраханской обл. В свою очередь гаплотип 12 в качестве производного имеет самый пред-
ставленный в данной группе гаплотип 13, объединяющий образцы всех астраханских популяций
Ch.
ambigua
и по одной аллели образцов из популяций
Ch. brevirostris
из Р. Калмыкия и из Астраханской
обл., а также
Ch. laticoronata
из этого же региона. Производным гаплотипа 13 является гаплотип 14,
состоящий из отдельных аллелей образцов из популяций
Ch. brevirostris
, произрастающих в Астрхан-
ской обл. Производным гаплотипа 14, в свою очередь, является гаплотип 15, состоящий из отдельной
аллели образцов из популяции
Ch. brevirostris
из Астраханской обл. От следующей группы гаплоти-
пов гаплотип 15 отделяют шесть мутаций. В последней группе корневым является гаплотип 9, пред-
ставляя собой отдельную аллель образцов из популяции BR-1
Ch. brevirostris
(из Р. Калмыкия) и че-
рез промежуточный гипотетический гаплотип в качестве производного давая гаплотип 2. Самыми
представленными в этой группе являются гаплотип 2 и производный от него гаплотип 3. Тот и другой
объединяют в себе большинство образцов
Ch. acantholepis, Ch. canescens, Ch. graminea, Ch. juncea,
Ch. latifolia
без какой-либо приуроченности к таксону. Гаплотип 3 обнаружен также у всех гербарных
образцов
Ch. aspera
, собранных в Киргизии и Казахстане, и
Ch. gibbirostris
, собранного в Узбеки-
стане. Гаплотипы 4 и 5, как производные гаплотипа 2, объединяют в себе образцы различных попу-
ляций
Ch. canescens, Ch. graminea, Ch. juncea
без какого-либо разделения по морфологическим ви-
дам. В совокупности с гаплотипом 6, представленным всего одной аллелью
Ch. canescens
из Красно-
кутского р-на Саратовской обл., они образуют замкнутую петлю, как следствие гомоплазии или ги-
бридизации. Гаплотип 7 также является производным гаплотипа 2 и представлен отдельной аллелью
Ch. brevirostris
. Наряду с гаплотипом 8, а также с производным гипотетическим гаплотипом, распо-
ложенным в пределах выстроенной сети между корневым гаплотипом 9 и гаплотипом 2, образует за-
мкнутую петлю, как следствие гомоплазии. При этом гаплотип 8 представлен отдельной аллелью об-
разцов
из популяции
Ch. brevirostris
. Гаплотип 10 объединяет отдельные аллели всех образцов
Ch.
laticoronata
, представляя собой производное гипотетического промежуточного гаплотипа – предше-
ственника всех гаплотипов этой группы, – и, в свою очередь, не имеет в пределах выстроенной сети
производных гаплотипов.
Таким образом, генеалогический анализ показал разделение гаплотипов на две большие груп-
пы, если не считать корневой гаплотип 1, обнаруженный у
Ch. rouillieri
. При этом производные от
Do'stlaringiz bilan baham: |
