boshlanadi.
Masalan,
leysilfenilalanilglutamillizin.
Oxirgi
C-uchki
aminokislotaning nomi o`zgarmasdan qoladi.
Polipeptid zanjirda mustahkam strukturalar (tekis peptid guruhlar) bo`lib, ular
nisbatan harakatlanuvchi qismlar (-CHR) ga ega va u bog` atrofida aylanadi.
Polipeptid zanjirning bunday tuzilish xususiyati uning fazoviy shaklini tuzilishiga
ta’sir etadi.
Oqsil molekulasida aminokislotalar tartibi biroz o`zgargan holda ma’lum darajada
aminokislotalar uning biologik vazifasini buzmasdan almashinishi mumkin. Bunga
insulin zanjirlarida, sitoxromlarda anchagina aminokislotalar almashinganda ham
oqsil o`z vazifasini bajarishi misol bo`la oladi. Demak, bu o`zgarishlar ruxsat
berilgan almashinuvlarga kiradi. Ammo o`roqsimon kamqonlik kasalligida
gemoglobinni
tekshirish
tamomila
boshqa
hodisaning
ochilishiga
olib
keldi. Barvaqt o`limga sabab bo`ladigan bu kasallik gemoglobin molekulasini va
qizil qon tanachalari (eritrotsitlar)ning o`zgarishi tufayli ularning kislorodni
bog`lash qobiliyatini kamayishiga bog`liq. Bunday o`zgarishlar gemoglobinni
tashkil qiladigan 574 ta aminokislota qoldiqlaridan tuzilgan oqsil zanjirlaridan
birida, faqat bittagina aminokislotaning almashinuvidan kelib chiqadi: normal
gemoglobin (HbA) ning beta-zanjirida 6-o`rinda turgan glutamat kislota
o`roqsimon hujayra gemoglobini (HbS) da valin bilan almashingan. Bu patologik
gemoglobindan tashqari yana bir qancha boshqa nonormal gemoglobinlar ham
mavjud.
Oqsillarning ikkilamchi strukturasi polipeptid zanjirning fazoviy konfiguratsiyasi,
uning ayrim qismlarini bir-biriga nisbatan joylanishi va peptid zanjirining egilgan
holatini ta’riflaydi. Oqsilning bunday konfiguratsiyasi uning birlamchi
strukturasidan kelib chiqadi va undagi qo`shimcha kovalent disulfid va kuchsiz
vodorod bog`lari bilan mustahkamlanadi. Konfiguratsiyasi bo`yicha ikkilamchi
struktura spiral(alfa-spiral) va qatlam-varaqcha (beta- struktura va kross-beta-
shakl) turlariga bo`linadi.
alfa-spiral. Oqsilning bu turdagi ikkilamchi strukturasi doimiy takrorlanuvchi
spiralga ega bo`lib, bitta polipeptid zanjirning o`zida peptidlar o`rtasidagi vodorod
bog`lari yordamida hosil bo`lgan.
alfa-spiralning asosiy xususiyatlari:
1) polipeptid zanjirning spiral konfiguratsiyasi vintli simmetriyaga ega;
2) vodorod bog`lari har gal takrorlanuvchi birinchi va to`rtinchi aminokislota
qoldiqlarining peptid guruhlari o`rtasida hosil bo`ladi;
3) spiral aylanmasining muntazam takpoplanishi;
4) alfa-spiralning hamma aminokislota qoldiqlari ularning yon zanjirlari qanaqa
bo`lishidan qat’i nazar bir xil ahamiyatga ega;
5) aminokislotalarning yon zanjirlari alfa spiralning hosil bo`lishida ishtirok
etmaydi.
Tashqi tomondan alfa- spiral elektr plitasining biroz cho`zilgan spiraliga o`xshaydi.
alfa-spiralda vodorod bog`lar har bir karbonil va to`rtinchi amino guruhning
orasida hosil bo`ladi: alfa – spiral oqsil molekulasi ikkilamchi strukturasining
asosidir. Uning har bir aylanmasi (kichik davri)ning uzunligi 0,54 nm bo`lib, 3,6 ta
aminokislota qoldig`idan tashkil topgan, ya’ni har bir aminokislota qoldig`ining
uzunligi 0,15 nm (0,54: 3,6= 0,15 nm) bo`lib, alfa-spiralda haqiqatan ham har bir
Do'stlaringiz bilan baham: |