|
Tanlash maydonlari guruxi - menyuning bitta va faqat bittasi tanlanadigan bandlari (Masalan, piktogramma, muloqot oynasi maydonlari). Tanlangan maydon bajariladigan vazifani mumkin bo‘lgan hollaridan birini amalga oshirishni ta’minlaydi.
Tarmoq grafigi - tarmoqning aloqa kanallari orqali vaqt birligi ichida o‘tuvchi axborot hajmi. U muhim ko‘rsatkich bo‘lib tarmoqning qanchalik bandligini va holatini ko‘rsatadi.
Telekommunikatsiya - axbortni uzatishga telealoqa vositalarini qo‘llash.
Uskunalar paneli - foydalanuvchi grafik interfeysi elementlari. Uning yordamida uskunaviy vazifalar va programma boshqaruvi bajariladi.
Fayl adresi - faylning to‘la nomi bo‘lib, u fayl joylashgan diskning mantiqiy nomi, unga yo‘l va nomi hamda kengaytmasini ko‘rsatadi. Masalan: S: -kafedra-kitob-bob1.txt.
Fayllarni arxivliash - diskdagi joyni tejash maqsadida fayllar guruxini bitta arxiv faylga joylashtirish amali.
Faylni chetlatish - diskda shu fayl joylashgan qismni boshqa fayllar joylashishi uchun ochiq deb e’lon qilish.
Hujjat - amaliy programma yordamida qayta ishlanadigan ob’ekt.
Egiluvchan disk - axborotlarni doimiy saqlash uchun ishlatiladigan magnitli axborot to‘plagich.
Elektron jadvallar - jadval ma’lumotlarini qayta ishlash uchun mo‘ljallangan programma vositalari.
Elektron nashr – maqola va kitoblarni kompyuterda tashkil qilish va undan foydalanish tizimi.
Insight II (Accelrys), SYBYL (Tripos) - molekulyar modellash uchun kuchli grafik interfeysga ega kupmaqsadli dasturiy komplekslar –oqsil tuzilishlarini tuzish, optimizatsiya va solishtirish; struktura ma’lumotlarini kuzatish, molekulyar-mexanik hisoblash, molekulalararo ta’sirlashishlarni o‘rganish uchun de novo dizayni, ma’lumotlar bazalari bilan ishlash, kutubhonalar dizayni, xemiinformatika.
Modeller (University of California) - bioinformatika va hisoblash strukturaviy biologiya – bitta yoki birnechta shablon strukturalari asosida oqsil strukturasini avtomatik modellash dasturi, shuningdek xar hil fazoviy cheklashlar.
AMBER (Assisted Model Building with Energy Refinement) (The Scripps Research Institute, California) – molekulyar-dinamik hisoblashlarni bajarish uchun kuchli dasturiy paket (Amber 9 ohirgi versiyasi QM/MM hisoblashlarni amalga oshirish imkoniyatini beradi).
Gromacs – dinamik hisoblashlar uchun va molekulyar traektoriyalarni analiz qilish uchun dasturiy paket. Molekulyar-dinamik hisoblashlarni o‘tkazish uchun eng tezkor dasturlarning biri.
ACD/3D Viewer – molekulyar strukturani ikkio‘lchamli ko‘rinishdan uch o‘lchamli ko‘rinishga o‘tkazish konvertori (ACD/ChemSketch dan).
MathMol - Mathematics and Molecules (New York University) – molekulyar modellash bo‘yicha ta’lim resursi.
Dasturiy ta’minotlarni ishlab chiqarish katta firmalari
Accelrys – kimyoviy va farmatsevtik ilmiy-tekshirish ishlanmalarni amalga oshirishning kuchli dasturiy instrumentlari. eng tanilgan maxsulotlar: Accord (xemiinformatika), Catalyst (struktura-faollik nisbiyligini o‘rganish), Cerius2 (struktura ratsional dizayni), Discovery Studio (oqsil modellash va hisoblash kimyosi), GCG (bioinformatika, to‘liq paketi 140 tadan ortiq dastur va utilitalardan iborat), Materials Studio (eritmalarni, kristallik strukturalarni va kristallografik jarayonlarni, polimer xossalarni, katalizni modellash, struktura-faollik nisbiylikni o‘rganish uchun instrumentlar tuplami), Pipeline Pilot (ma’lumotlar analizi), QUANTA (RSA kristallografiya).
Advanced Chemistry Development - ACD/Labs – kimyoviy dasturiy ta’minotni ishlab chiqarish kompaniyasi.
MDL (Elsevier MDL) - MDL Discovery Framework, MDL Discovery Knowledge, MDL Isentris, MDL Isis, MDL Chime, MDL Cheshire, MDL Direct.
Molecular Discovery Ltd – (asosan farmatsevtik kompaniyalar uchun) dasturiy ta’minot – struktura va xossa orasidagi bog‘likni analiz qilish, struktura molekulyar dizayn (Structure-Based Drug Design), ADMET (yutilish, taqsimlanish, metabolizm, chiqarish), xemoinformatika va bioinformatika. Asosiy dastur maxsulotlari: GRID (ligan-bog‘lash saytlar sifatida amalga oshish uchun energetik jihatdan qulay sohalarini makromolekula yuzida qidirish), VolSurf (fazoviy ta’sirlashish panjaralar asosida 2D molekulyar deskriptorlarni generatsiya qilish, dasturning asosiy maqsadi – 3D kartada joylashgan informatsiyani tushinish uchun va interpretatsiya uchun oson birnecha sonli 2D deskriptorlargacha siqish), MetaSite (birikmalarning 3D strukturasiga asosan ksenobiotiklar metabolizmi saytini oldindan aytish), Almond (tekislanishga bog‘liq emas GRIND deskriptorlari ustida generatsiya va operatsiyalar qilish), Shop ("Scaffold Hopping" metodologiyasini qo‘llash (g‘oyaning ma’nosi – farmakafor o‘zaro ta’sirlashishlarining saqlangan holda molekulaning bitta qismini boshqa qismiga almashtirish)).
OpenEye Scientific Software – molekulyar modellash va xemoinformatika uchun dasturlar. Xar hil “yordamchi” dasturlar: Afitt (kristallografik modellarni tuzish), Babel3 (formatlarning fayl konvertori), Brood (bioizoster fragmentlarini identifikatsiya qilish), Eon (elektrostatik o‘hshashlik qidirish), Filter (dorivor xossalariga o‘hshash xossalarni qidirish), Fred (mul’tikonformer doking), Lexichem (kimyoviy nomlanish), Omega (mul’tikonformerlarni generatsiya qilish), Quacpac (atom zaryadlari, protonlanish, tautomerlar), Szybki (oqsil/ligand analizi va optimizatsiya), Vide (kuzatish), Wabe (izoster analoglarini o‘rganish).
SoftBerry - bioinformatsion dasturiy ta’minot (yuzga yaqin), dasturiy maxsulotlarining biri - MolQuest.
SimBioSys Inc - Simulated Biomolecular Systems Inc. - software for rational drug design – dorivor preparatlarning ratsional dizayni uchun dasturiy ta’minot.
Tripos – SYBYL asosiy dasturiy maxsulotlar (hisoblovchi olimlar uchun molekulyar modellash uchun ko‘pfunktsiyali paket), Benchware (laboratoriyada foydalanish uchun ma’lumotlar va boshqa foydali ahborotlar dasturiy paketi).
Do'stlaringiz bilan baham: |
