9- seminar. Oqsil molekulalarida gomologik domenlarni izlash Protein domeni oqsilning uchinchi darajali tuzilishining elementi bo'lib, u ancha barqaror va mustaqil protein substruktsiyasi bo'lib

mumkin. Aynan, evolyutsiyaga bog'liq bo'lgan proteinlar turli xil tuzilmalarni 
o'z ichiga oladi va shuning uchun ularni turli sohalarga ajratish mumkin. 
Bundan tashqari, so'nggi yillarda protein tarkibidagi tuzilmalar haqida 
mavjud ma'lumotlarning ko'payishi bilan bunday misollar ko'payib 
bormoqda. 
80-yillarning 
boshlarida 
olimlar 
oqsil 
tuzilmalarida 
takrorlanadigan motiflarni tasvirlashdi. Bugun ular oqsillarni evolyutsiya 
jarayonida bitta tarkibiy sababdan boshqasiga o'zgartirishi qanday usullarni 
muhokama qilishadi. Ushbu mexanizmlar katta qiziqish uyg'otdi, chunki ular 
oqsil dunyosining tuzilishini tushunishimizga kuchli ta'sir qilishi aniq bo'ldi. 
Ularning mavjudligi molekulyar modellashtirish texnikasida qiyinchiliklarga 
olib keladi, bu "bir xil ketma-ketliklar - bir xil tuzilmalar" tezisiga juda 
ishonadi.
Darhaqiqat, agar ma'lum bir usul to'plamidan foydalangan holda ushbu 
ketma-ketlikning o'xshashligi aniqlansa, ikkita ketma-ketlik o'xshash fazoviy 
tuzilishga ega bo'ladi degan fikr keng tarqalgan. Bundan tashqari, evolyutsiya 
paytida strukturaning muhim qismlarini o'zgartirish imkoniyati oqsillarni 
ketma-ketligi va tuzilishiga qarab tasniflashga qarama-qarshilikni keltirib 
chiqaradi.
Ammo, 
eng 
asosiy 
savol, 
protein 
tarkibidagi 
tuzilmalar 
va 
mexanizmlarning evolyutsiyasi bilan bog'liq bo'lib, ularda oqsillar to'planishi 
o'zgarishi mumkin. Hozirgi vaqtda ushbu mexanizmlar ham amaliy, ham 
nazariy jihatdan kam o'rganilgan.
Nazorat savollari: 
1.
Domen nima?
2.
Domenlarni izlash metodlari?