3-Amaliy mashg‘ulot

3-Amaliy mashg‘ulot.
Ma’lumotlar bazasi va ulardan foydalanish. Ishdan maqsad: Nukleotid ketma-ketliklar ma’lumotlar bazasi (EMBL, DDBJ, NCBI, UniGene, STACK, EMBL-SVA) resurslari bilan tanishish. Genom ma’lumotlar bazasi (Genomes Server, Proteome Analysis, Ensembl) resurslari bilan tanishish. Oqsil ketma-ketliklari ma’lumotlar bazasi hamda aminokislota ketma-ketliklari ma’lumotlar bazasi (UniProtKB/Swiss-Prot, GOA, ENZYME) resurslari bilan tanishish. NCBI ma’lumotlar bazasi BLAST tahlili va Ugene 1.21.0 dasturiy ta’minotidan foydalanib genlarni anotasiya qilishni o‘rganish. Masalaning qo‘yilishi: Tinglovchi amaliy mashg‘ulotda keltirilgan vazifalarni bajarishi, tahlil qilishi va natija olishi lozim. Ishni bajarish uchun namuna.
1-vazifa. 1-amaliy mashg‘ulot natijasida aniqlangan QTL markerining G.hirsutum g‘o‘za turi to‘liq genomidan foydalanib In silico PCR algoritmi bilan Ugene 1.21.0 dasturida tegishli DNK ketma-ketligini aniqlang.





2-vazifa. In silico PCR mahsulotidan olingan DNK ketma-ketligini NCBI ma’lumotlar bazasiga yuklang.


3-vazifa. NCBI ma’lumotlar bazasiga yuklangan DNK ketma-ketligini tahlil qilish uchun BLAST tugmasini bosing.


4-vazifa. Qidiruv natijasida topilgan ketma-ketliklarni birma-bir tahlil qiling.


5-vazifa. Tegishli (mos keluvchi) gen/oqsil yoki lokus ketmaketliklarini Ugene 1.21.0 dasturida ham tahlil qilib ko‘ring.